目前市场上许多特殊医学用途配方食品（下文简称为“特医食品”）为粉状的罐装产品，特别是全营养或特定全营养特医食品，其包装、产品感官性状、食用方法以及味道等方面与乳粉都较为相似，很多人将这类罐装的产品称为“奶粉”，易造成混淆。但事实上，两者还是有很大差别的，主要差别在“配方”两字上，“配方”是指为满足某一特殊人群的营养需求而专门设计的，在营养成分、产品用途、适用人群和法规监管方面与乳粉完全不同，属于两类产品。
一、用途不同
全营养配方或特定全营养配方特医食品，可作为特定疾病状态人群的唯一食物，营养均衡适宜。一是营养素种类齐全，涵盖了蛋白质、脂肪、碳水化合物三种宏量营养素，还有各种维生素和矿物质等微量营养素；二是营养素含量适宜，遵医食用，能满足目标人群的营养素需要量。这类食品通常采用乳清蛋白或酪蛋白或大豆分离蛋白、麦芽糊精、植物油脂、维生素、矿物质等调配制成。
乳粉是由动物乳汁经喷雾干燥制成的，最后加工成普通奶粉或（强化了营养素）的营养强化奶粉，普通人群及普通病人都可以食用，市场上的老年奶粉、孕妇奶粉属于营养强化奶粉。从营养角度看，膳食乳类食品主要是提供优质蛋白和补钙。比如100ml牛奶中含蛋白质3.3g，含钙107mg；100g全脂奶粉中含蛋白质19.9g，含钙928mg，含量都要高于其他食品，也远高于特医食品。正常人不能以乳粉来代餐，作为惟一膳食来源，否则将造成膳食与营养都不平衡，影响身体健康。另外，对于乳蛋白过敏者及乳糖不耐者，不宜食用乳粉。
二、市场准入不同
特医食品在我国是按特殊食品进行管理，在上市前，该类产品需要经过国家食品安全监督管理部门专门的注册审批，在获得产品注册证书，还要根据《食品生产许可管理办法》规定的条件和程序提出特医食品的生产许可申请，取得对应产品的食品生产许可证后，方可生产。
乳粉按普通食品进行管理，无需产品注册，只要企业根据《食品生产许可管理办法》规定的条件和程序提出乳粉的生产许可申请，取得对应产品的食品生产许可证后，即可生产。
另外，销售特医食品，需要有专门的食品经营许可证。